Οι μεταπτυχιακοί/ές φοιτητές/τριες καταβάλλουν τέλη φοίτησης για το ΠΜΣ. Το ποσό των τελών φοίτησης για κάθε φοιτητή/τρια καθορίζεται από το χειμερινό εξάμηνο του ακαδημαϊκού έτους 2018-2019 σε 650 ευρώ ανά εξάμηνο. Η επιβολή τέλους φοίτησης, το οποίο είναι ιδιαίτερα χαμηλό, είναι αναγκαία γιατί το Τμήμα δεν διαθέτει πόρους για τη λειτουργεία μεταπτυχιακών προγραμμάτων κι έτσι σε αντίθεση περίπτωση το ΠΜΣ δεν θα έχει τους αναγκαίους πόρους για να καλύψει λειτουργικές ανάγκες, αμοιβές εξωτερικών συνεργατών ή και επισκεπτών καθηγητών από το εξωτερικό. Όσον αφορά τη δυνατότητα παροχής υποτροφιών και εκπαιδευτικών δανείων σε μεταπτυχιακούς φοιτητές του παρόντος Προγράμματος, ισχύουν τα προβλεπόμενα από τα άρθρα 54 Ν. 4009/2011 και 35 παρ. 4 Ν. 4485/2017.
Τα τέλη φοίτησης καταβάλλονται όχι μόνον για τα τρία εξάμηνα κανονικής διάρκειας των σπουδών, αλλά για όλα τα εξάμηνα φοίτησης έως τη συμπλήρωση της ανώτατης προβλεπόμενης διάρκειας των σπουδών. Τα τέλη φοίτησης καταβάλλονται μέχρι την 30η Σεπτεμβρίου για κάθε χειμερινό εξάμηνο και μέχρι την 30η Ιανουαρίου για κάθε εαρινό εξάμηνο. Τα τέλη φοίτησης καταβάλλονται σε τραπεζικό λογαριασμού του Ειδικού Λογαριασμού Κονδυλίων Έρευνας του ΕΚΠΑ και ο μεταπτυχιακός φοιτητής προσκομίζει την απόδειξη στη Γραμματεία του Τμήματος ΕΜΜΕ/ΠΜΣ προκειμένου να του χορηγηθεί εξοφλητική απόδειξη και να ενημερωθεί ο φάκελός του. Σε περίπτωση μη καταβολής των τελών φοίτησης, ο μεταπτυχιακός φοιτητής δεν έχει δικαίωμα παρακολούθησης του ΠΜΣ. Στην περίπτωση αυτή η Γραμματεία ενημερώνει τον Διευθυντή και τη ΣΕ του ΠΜΣ. Ο χρόνος μη παρακολούθησης λόγω μη καταβολής των τελών φοίτησης συνυπολογίζεται στο χρόνο φοίτησης για όλες τις συνέπειες και ιδίως για την υπέρβαση του ανώτατου χρόνου φοίτησης, οπότε επέρχονται οι συνέπειες του άρθρου 3 παρ. 2β του Κανονισμού. Τέλη φοίτησης που έχουν καταβληθεί δεν επιστρέφονται. Ιδίως δεν αποτελεί λόγο επιστροφής καταβληθέντων τελών φοίτησης η μη παρακολούθηση των μαθημάτων, η εγκατάλειψη των σπουδών, η ανάκληση της δήλωσης εγγραφής στο ΠΜΣ, καθώς και η αίτηση διαγραφής από αυτό που οφείλονται σε υπαιτιότητα του φοιτητή/τριας.